在我们的生活中，引起肛周脓肿的因素很多，按照发病原因可以对肛周脓肿进行分类，具体分类如下：

(1)按感染病菌分类：①非特异性肛周脓肿：由大肠埃希杆菌、厌氧菌等混合感染引起;

②特异性感染：临床较为少见，以结核性脓肿为主。

(2)按脓肿部位分类：①肛提肌下脓肿(低位脓肿)：包括肛周皮下脓肿、坐骨直肠间隙脓肿、低位马蹄形脓肿等;

②肛提肌上脓肿(高位脓肿)：包括骨盆直肠间隙脓肿、直肠后间隙脓肿和高位马蹄形脓肿等。

(3)按脓肿的最后结局分类：Eisenhammer(1978)将肛管直肠周围脓肿分成瘘管性脓肿及非瘘管性脓肿2大类。

①非瘘管性脓肿：凡与肛窦、肛腺无关，最终不残留肛瘘者，均属非瘘管性脓肿;

②瘘管性脓肿：即为经肛窦、肛腺感染而致，最后遗留肛瘘者。