1、定位准确。术前明确部位、范围、内口。可在麻醉下通过指诊、穿刺等确定部位。通过肛门钟、指诊、探针、染色等确定内口。内口不明，宜分期治疗。
2、切口宜大，使引流务畅。脓腔应充分打开，不留无腔。术中可用指探查、分开脓胀内口的纤维间隔，以利引流。
3、手术要注意肛门功能的保护。不主张对括约肌或肛直环的一次性切开、尤其高位脓肿受累的括约肌或肛直环较多，切开必然导致肛门失禁。故挂线法值的提倡。远端要伤口深大者，宜缝合，其一可加迷伤口愈合，缩小疗程；其二可减少疤痕面积，减小肛门畸形。实践证明，只要操作准确，脓腔、原发灶清理干净，近端伤口引流通畅，是不会感染的。
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