正常人尿液中的一些溶解物质，因各种原因造成沉淀，潴留于肾内，并持续生长，便可形成结石。肾结石多发生在中壮年，男性多于女性。肾结石可能长期存在而无症状，特别是较大的结石。较小的结石活动范围大，当小结石进入肾盂输尿管连接部或输尿管时，引起输尿管剧烈的蠕动，以促使结石排出，于是出现绞痛和血尿。

肾结石引起的疼痛可分为钝痛和绞痛。40％—50％的病人都有间隙发作的疼痛史。疼痛常位于腰部和腹部，多数呈阵发性，亦可为持续疼痛。有的疼痛可能仅表现为腰部酸胀不适，活动或劳动可促使疼痛发作或加重。肾结石绞痛呈严重刀割样痛，常突然发作，疼痛常放射至下腹部、腹股沟或股内侧，女性则放射至阴唇。肾绞痛发作时，患者呈急性病容，蜷曲在床，两手紧压腹部或腰部，甚至在床上翻滚，呻吟不已。发作常持续数小时，亦可数分钟即缓解。肾绞痛严重时，面色苍白，全身出冷汗，脉细而速，甚至血压下降，呈虚脱状态，同时伴有恶心、呕吐、腹胀便秘。绞痛发作时，尿量减少，绞痛缓解后，可有多尿现象。 肾结石的症状取决于结石的大小，引起梗阻的程度和有无继发感染。在肾孟中不活的结石而又无感染时，可长期无症状，甚至结石已引起肾功能不足时还无自觉症状，只在摄腹部X线照片时偶然发现。但大多数患者有症状。 疼痛和血尿是肾结石的主要症状。约75%肾结石患者有腰痛。结石较大，在肾盂中移动度较小时，疼痛多为钝痛，有时是隐痛。结石小，在肾盂内移动度大时。容易引起肾盂输尿管联接部的梗阻而出现肾绞痛。肾绞痛是一种突然发生的严重疼痛，从腰部开始，沿输尿管向下放射至膀胱。痛呈阵发性，一般持续数分钟，亦可长达数小时，并有恶心呕吐，有时病人面色苍白，大汗淋漓，呈虚脱状态。

血尿是第二个重要症状，疼痛和血尿相继出现是肾和输尿管结石的特点；尤其是体力活动较多时，如劳动、运动、骑马和乘车时突然发生疼痛和血尿。但血尿一般较轻，有时肉眼不能看出，但几乎每个病例都能在显微镜下见到从少数到多数红细胞，因此尿的显微镜检查很重要。 一部分患者在临床上并无结石病的典型疼痛及血尿，而因泌尿系感染的症状就医。在这一类患者中如不追究引起感染的原发病因，不做泌尿系平片及静脉泌尿系X线造影检查，就容易忽略结石的存在。

肾结石患者偶有排出结石或小砂粒的病史，这就有助于诊断。双侧肾结石引起梗阻或患者唯一的肾(例如另一肾已切除)发生梗阻，可出现急性无尿。有时由于肾一肾反射，一例肾结石可引起对侧腰痛。单侧肾结石梗阻也可以引起急性无尿。 肾结石如不因梗阻引起肾积水或发生继发感染时，体格检查可能出现肾区叩击痛亦可无异常所见。输尿管结石和肾结石的症状基本相似。结石的大小与梗阻、血尿和疼痛程度不一定成正比。在输尿管中、上段部位的结石嵌顿堵塞或结石在下移过程中，常引起典型的患侧肾绞痛和镜下血尿。

疼痛可向大腿内侧、睾丸或阴唇放射。常伴有恶心、呕吐，有时血尿为肉眼可见。输尿管膀胱壁间段最为狭小，结石容易停留。由于输尿管下段的肌肉和膀胱三角区相连，并且直接附着于后尿道，故常伴发尿频、尿急和尿痛的特有症状。在不影响尿流通过的较大结石，可仅有隐痛，血尿也轻。在孤立肾的输尿管结石阻塞或双侧输尿管阻塞，或一侧输尿管结石阻塞使对侧发生反射性无尿等情况，都可发生急性无尿，甚至肾功能不全。